企業(yè)內(nèi)部控制體系與企業(yè)流程管理有著緊密的聯(lián)系，因為流程是公司戰(zhàn)略、理念、策略和有效內(nèi)部控制的載體。流程管理是企業(yè)最基礎(chǔ)的管理行為。在企業(yè)內(nèi)部控制解決方案的研究和設(shè)計過程中應以流程管理為基礎(chǔ)。即做到規(guī)范流程、優(yōu)化流程和再造流程，使企業(yè)內(nèi)部控制體系更加有效和便于實施。

實現(xiàn)流程管理是擺在企業(yè)面前的一個刻不容緩要解決的問題，也是企業(yè)徹底改善以前傳統(tǒng)管理模式，使企業(yè)內(nèi)部控制躍上一個新臺階的必經(jīng)之路。作為管理控制系統(tǒng)的重要組成部分。目前的內(nèi)部控制系統(tǒng)更多的是與層級制的分權(quán)組織相適應，而較少有適應扁平化組織流程導向的內(nèi)部控制系統(tǒng)的成熟模式。企業(yè)要實現(xiàn)流程化管理，有必要完成以下程序：

要做好信息收集工作。企業(yè)在識別原有流程時，首先要收集大量的關(guān)于原有流程的信息。只有收集到準確和詳細的信息，流程優(yōu)化和設(shè)計的實施者才能夠充分認識企業(yè)原有流程，了解原有流程的現(xiàn)狀。發(fā)現(xiàn)原有流程中存在的問題。從而為今后工作的展開奠定良好的基礎(chǔ)。

要識別與描述企業(yè)流程。大多數(shù)實旋流程改迸與設(shè)計的企業(yè)。在實施改進前。都是以職能的形式進行管理。企業(yè)在進行流程改進與設(shè)計前首先要識別企業(yè)中現(xiàn)有的流程。并且以一定的方式描述出來，以利于發(fā)現(xiàn)流程中存在的問題，進而設(shè)計新的流程或改進原有流程，以達到大幅度提高企業(yè)效率的目的。

選擇關(guān)鍵流程。通常情況下，一個企業(yè)內(nèi)的流程有成百上千。這些流程大致可分為兩種類型：一類是圍繞職能線形組織運轉(zhuǎn)的子流程，從單個部門內(nèi)進行投入，并在這個部門形成產(chǎn)出；一類是跨職能流程。這類流程橫跨多個職能部門，沒有一個人對整個流程負全責。我們所要選擇的關(guān)鍵流程應當是第二類跨職能流程。

選擇需要改進的關(guān)鍵流程。每家企業(yè)都有很多關(guān)鍵流程，但并不是所有關(guān)鍵流程都存在問題，況且企業(yè)的資源有限，企業(yè)應當優(yōu)先選擇存在重大問題的關(guān)鍵流程進行改進。

確定需要改進的關(guān)鍵點。在確定了需要改進的關(guān)鍵流程后，就需要對這些流程進行診斷。每個流程都是由一系列活動組成的，但并不是每一個活動都需要改進。因此，需要找出這些流程中導致績效低下的關(guān)鍵點。然后分析造成問題的原因，從而開始流程的再設(shè)計。流程管理不是一個簡單的流程圖或者是一個標準操作程序就可以解決或處理的問題，而是必須通過公司決策機構(gòu)、職能管理層及操作層不斷摸索、不斷提煉來得出的，是帶有公司個性化的管理思路。